Beberapa fasilitas yang dimiliki Bank Gen Balitbangtan – BB Biogen untuk konservasi sumber daya genetik (SDG) pertanian meliputi:
Laboratorium Bank Gen dan Genetika Tanaman, memiliki 6 buah deep freezer (temperatur “¬“18oC), 3 buah chiller (temperatur 0-5oC) dan ruangan penyimpanan benih (temperatur 15-20oC dan kelembaban 50%) untuk penyimpanan benih padi, jagung, kedelai, sorgum dan aneka kacang.
Field gene bank untuk konservasi lapang SDG ubikayu, ubijalar dan aneka ubi potensial.
Laboratorium Kultur In Vitro, yang dilengkapi perangkat penunjang untuk konservasi SDG tanaman pangan secara in vitro dan kriopreservasi.
Ruang komputer, untuk kegiatan dokumentasi (database) SDG pertanian.