Bank Gen Pertanian yang berlokasi di BB Biogen merupakan Bank Gen Nasional untuk mendukung kegiatan pengelolaan sumber daya genetik (SDG) pertanian di bawah koordinasi Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian (Balitbangtan), Kementerian Pertanian. Dalam kapasitasnya sebagai Bank Gen Nasional, Bank Gen Pertanian lebih memprioritaskan untuk melakukan pengelolaan koleksi dasar (base collection), di samping juga koleksi aktif (active collection) SDG pertanian untuk mendukung kegiatan penelitian. Dengan demikian maka koleksi SDG pertanian di Bank Gen Pertanian mencakup duplikat dari koleksi SDG pertanian di seluruh Sub-bank Gen Lingkup Balitbangtan. Sub-bank Gen tersebut merupakan bank gen yang berada di unit kerja (UK) berbasis komoditas, yang lebih memprioritaskan untuk melakukan konservasi koleksi aktif untuk mendukung program pemuliaan. Sub-bank Gen di bawah koordinasi Balitbangtan tersebut adalah: